An alternative to the GCA model wit

An alternative to the GCA model with fixed group effects is an individual model with genetic groups accounted for in the pedigree rather than explicitly as a factor in the model. This alternative will produce directly a net breeding value that includes the group effect.
Furthermore, this alternative method is useful for later generations of progenies that may trace ancestry to more than one founder group. We need to create a pedigree file in order to include the genetic group information as part of the pedigree. This is done by including the genetic group identifiers at the beginning of the file, then indicating the group identifier as the male and female parents of the individuals in the first sampled generation from the genetic groups. The pedigree file (“pine_provenance_pedigree.txt”) appears as:

結果 (中文) 1:

GCA 模型与固定的组效果的替代方法是单个模型与遗传群体占血统的而不是显式模型中的一个因素。此替代方法会直接产生网育种值，包括群体效应。此外，这种替代方法是有用的以后几代人的可能的祖先追溯到多个创始人组的后代。我们需要创建一个谱系文件以包括作为一部分的谱系的基因组信息。这是通过包括遗传组标识符开头的文件，然后在从基因组的第一采样代作为个人的男性和女性的父母指示的组标识符。家谱文件 ("pine_provenance_pedigree.txt") 将显示为︰

結果 (中文) 2:

与固定群体效应的GCA模型的替代方法是与遗传群体的个体模型占血统，而不是明确地作为模型的一个因素。这一替代将直接产生净育种值包括所述组的效果。
此外，这种替代的方法是为以后可能追溯祖先到多个方正集团后代的后代是有用的。我们需要以包括基因组信息作为开山鼻祖的一部分来创建一个系谱档案。这是通过包括基因组标识符在文件的开头，则表示该组标识符作为雄性和雌性亲从基因组中的第一个采样的代个体的完成。系谱文件（“pine_provenance_pedigree.txt”）显示为：

結果 (中文) 3:

在GCA模型替代固定的群体效应与遗传群体的个体模型占的血统而不是显式模型中的一个因素。这种选择将直接产生净育种值，其中包括组效果。此外，这种替代方法是有用的为后人可以追溯祖先的后代，一个以上的方正集团。我们需要创建一个谱系文件，以便将遗传群体信息作为系谱的一部分.。这是通过在文件开始时包括遗传组标识符，然后将组标识符表示为第一个从遗传组产生的个体中的男性和女性双亲.。家谱文件（“pine_provenance_pedigree .txt”）出现：