In the β-fibint7 dataset, the numbe

In the β-fibint7 dataset, the number of haplotypes (h),nucleotide diversity index (π, Nei 1987), haplotype diversity (Hd) and the average number of nucleotide differences (k) were used as estimates of the genetic diversity of the total dataset and within the main haplogroupsdetected. Genetic diversity calculations were performed excluding recombinant sequences for theglobal data set and within distinctive haplogroups using DnaSP v4.10.9 (Rozas et al., 2003). We used the software PHIPACK (Bruen et al., 2006) to evaluate the presence of recombination in β-fibint7 sequences using the pairwise homoplasy index. This method has been shown by simulation studies to be less sensitive than other available statistics to falsely infer recombinationwhen levels of recurrent mutation are high (Bruen et al., 2006). We used a permutation test (1000 permutations) to estimate the p-values for the null hypothesis of no recombination.Intraspecific median-joining haplotype networks were constructed for both β-fibint7 and the combined nad4 and control region sequences in Network version 4.2 (Bandelt et al., 1999).

結果 (繁體中文) 1:

在β-fibint7數據集，單倍型（h）中，核苷酸多樣性指數（π，NEI 1987），單倍型多樣性（HD）和核苷酸差異（k）的平均數量的數量被用作的遺傳多樣性的估計總數據集以及主單倍群內
檢測到。進行遺傳多樣性的計算不包括對重組序列
全局數據集，並使用DnaSP v4.10.9獨特單倍群內（羅薩斯等人，2003）。我們所使用的軟件PHIPACK（Bruen等人，2006），以評估重組在使用成對趨同性指數β-fibint7序列的存在。該方法已通過模擬研究顯示出比其他現有統計數據來推斷虛假重組不太敏感
當發突變的水平是很高的（Bruen等，2006）。我們使用了排列檢驗（1000置換）來估計不重組的零假設的p值。
種內中值接合單元型網絡構建兩種β-fibint7和在網絡版本4.2組合nad4和控制區序列（Bandelt等人，1999）。

結果 (繁體中文) 2:

在β-fibint7資料集中，使用單倍型（h）、核苷酸多樣性指數（*，Nei 1987）、單倍體多樣性（Hd）和平均核苷酸差異數（k）作為總資料集遺傳多樣性的估計值，在單倍組
檢測。進行遺傳多樣性計算，排除了
使用DnaSP v4.10.9（Rozas等人，2003年）在獨特的單倍組中進行全球資料集。我們使用軟體PHIPACK（Bruen等人，2006年）使用對同構指數評估β-fibint7序列中是否存在重組。模擬研究表明，這種方法比其他可用統計資料的敏感程度要低，無法錯誤地推斷重組
當復發性突變水準高時（Bruen等人，2006年）。我們使用排列檢驗（1000 個排列）來估計無組合的零假設的 p 值。
在網路版本4.2（Bandelt等人，1999年）中，為β-fibint7和結合nad4和對照區域序列構建了特異性中聯單體網路。

結果 (繁體中文) 3:

在β-fibint7數據集中，用單倍型數（h）、核苷酸多樣性指數（π，Nei 1987）、單倍型多樣性（Hd）和核苷酸差异平均數（k）作為總數据集和主要單倍型組內遺傳多樣性的估計
檢測。進行遺傳多樣性計算，排除
使用DnaSP v4.10.9的全域數据集和獨特的單倍型組內（Rozas等人，2003）。我們使用PHIPACK軟件（Bruen等人，2006年）使用成對同質化指數評估β-纖維蛋白7序列中是否存在重組。類比研究表明，這種方法比其他可用的統計方法對錯誤推斷重組的敏感性要低
當反復突變的水准很高時（Bruen等人，2006）。我們使用置換測試（1000個置換）來估計無重組的零假設的p值。
在網絡版本4. 2中，為β-fibint7和nad4和控制區組合序列構建了種內中位數連接單倍型網絡（Bandelt等人，1999）。