Multiple-sequence alignments• Uses

Multiple-sequence alignments• Uses of multiple-sequence alignments– Automated reconstruction of sequencefragments in sequencing projects– Phylogenetic analysis– Identification of sequence families• The problem of multiple-sequence alignment– O(NM) where N is the average sequence lengthand M is the number of sequences being aligned– Dynamic programming will work only for small M(8-10 sequences)– Heuristic methods are required

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多序列比對 •多序列比對的使用 -自動重建序列的 在測序項目片段 -系統發育分析 -序列家族的鑑定 •多序列比對的問題 - O（NM），其中N是平均序列長度 和M被比對的序列的數目 -動態編程將只為小M （8-10序列） -是必需的啟發式方法

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多序對齊 • 使用多序對齊方式 • 序列的自動重建 測序專案中的片段 • 植物遺傳學分析 • 序列族的標識 • 多序列對齊問題 • O（NM），其中 N 是平均序列長度 和 M 是對齊的序列數 • 動態程式設計僅適用于小型 M （8-10 序列） • 需要啟發式方法

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多序列比對 •多序列比對的使用 –序列的自動重建 排序項目中的片段 –系統發育分析 –序列家族的識別 •多序列比對問題 –O（NM），其中N是平均序列長度 M是被對齊的序列數 –動態程式設計僅適用於小型M （8-10個序列） –需要啟發式方法

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