Traditional microbiological methods

Traditional microbiological methods of cultivation recover less than 1% of the total bacterial species, and the culturable portion of bacteria is not representative of the total phylogenetic diversity. Classical cultivation strategies are now known to supply excessive nutrients to a
system and therefore select for fast-growing bacteria that are capable of colony or biofilm formation. New approaches to the cultivation of bacteria which rely on growth in dilute nutrient media or simulated environments are beginning to address this problem of
selection. Here we describe a novel microcultivation method for soil bacteria that mimics natural conditions.
Our soil slurry membrane system combines a polycarbonate membrane as a growth support and soil extractas the substrate. The result is abundant growth of uncharacterized bacteria as microcolonies. By combining microcultivation with fluorescent in situ hybridization, previously “unculturable” organisms belonging to cultivated and noncultivated divisions, including candidate division TM7, can be identified by fluorescence microscopy. Successful growth of soil bacteria as microcolonies confirmed that the missing culturable majority may have a growth strategy that is not observed when traditional cultivation indicators are used.

結果 (中文) 1:

种植传统的微生物方法恢复不到1％的总细菌物种，以及部分细菌的培养是不是代表的总系统发育多样性。古典栽培策略是目前已知供应过多的养分
系统，因此选择为快速增长的有能力菌落或生物膜形成的细菌。新方法在稀的营养介质或模拟环境的增长依赖于细菌的培养开始
的选择来解决这个问题。在这里，我们描述了一种新的土壤细菌，的microcultivati​​on方法，模仿自然条件。
我们的土壤泥浆膜系统结合了聚碳酸酯膜作为增长的支持和土壤extractas的基板。其结果是大量生长的未知细菌菌落。由结合microcultivati​​on荧光原位杂交，以前是“不可培养”属于的培育和noncultivated部门，包括候选师TM7的生物体，可以通过荧光显微镜。成功的成长的土壤细菌菌落证实，缺少培养的大多数可能有一个增长战略时，没有观察到使用传统的种植指标。

結果 (中文) 2:

传统的培养微生物的方法恢复小于1%的总细菌的种类，和细菌的培养部分不是总基因多样性代表。经典的培养策略是目前已知的
系统供应过量的营养物质，因此选择快速生长的细菌能够殖民地或生物膜的形成。对依赖于生长在稀营养介质或模拟环境开始解决这个问题的
选择细菌培养的新方法。在这里，我们描述了一种新的模拟自然条件下的土壤细菌microcultivation方法。
我们的土壤泥浆膜系统结合了聚碳酸酯膜作为生长支持和土壤extractas基板。结果是未知的细菌菌落生长为丰富。结合荧光原位杂交microcultivation，以前的“不可培养微生物属于非耕地和分歧，包括候选分割TM7，可以通过荧光显微镜鉴定。成功的生长土壤细菌菌落培养证实失踪的大多数可能已经增长策略，没有观察到传统栽培指标。

結果 (中文) 3:

传统的培养微生物方法恢复少于 1%总细菌的种类，并可培养细菌的部分不是总的系统发育多样性代表。古典培养战略目前已知供应过度营养素对
系统，因此选择为快速增长的殖民地或生物膜形成的有能力的细菌。新办法对培养的细菌，依靠增长稀释养分媒体或模拟的环境开始解决这一问题的
选择。这里我们介绍一种新型 microcultivation 方法土壤细菌的模仿自然条件。
我们土浆膜系统相结合的聚碳酸酯膜作为增长支持和土壤 extractas 基板。其结果是丰富细菌生长的无为 microcolonies。通过结合荧光原位杂交技术的 microcultivation，以前属于耕地和非分裂，包括候选人司 TM7，"无法"有机体可以识别的荧光显微。Microcolonies 确认缺少可培养大多数可能的增长战略，不是成功细菌生长的土壤观察当使用传统方法种植指标时。