المعلوماتية الحيوية هي مجال متعدد التخصصات التي تطور أساليب وأدوات البرمجيات لفهم البيانات البيولوجية. كما مجال متعدد التخصصات من العلوم ، والمعلوماتية الحيوية يجمع بين علوم الكمبيوتر والاحصاءات والرياضيات والهندسة لتحليل وتفسير البيانات البيولوجية. وقد شوهد ازدهار مفاجئ في البيانات البيولوجية بعد مشروع الجينوم البشري (HGP) ومشاريع التسلسل للكائنات الحية الأخرى. ويجري إدارة الطلب الهائل على تحليل وتفسيرات هذه البيانات من خلال العلم المتطور للمعلوماتية الحيوية. وتعرف المعلوماتية الحيوية بأنها تطبيق أدوات حسابية وتحليلية لالتقاط وتفسير البيانات البيولوجية.<br>وغالبا ما تركز المعلوماتية الحيوية على الحصول على البيانات الموجهة بيولوجيا – مثل الحمض النووي (الحمض النووي/ الجيش الملكي النيبالي) وتسلسل البروتين، والهياكل، والوظائف، والمسارات، والتفاعلات تنظيم هذه البيانات في قواعد البيانات، وتطوير أساليب لاسترداد المعلومات من قواعد البيانات هذه وأيضا لربط البيانات من مصادر مختلفة. والهدف الرئيسي من هذه الخوارزميات والبرامج هو تسريع عملية البحوث البيولوجية. علم الجينوم الوظيفي، الهياكل الجزيئية الحيوية، تحليل البروتيوم، استقلاب الخلية، التنوع البيولوجي، تصميم الدواء، تصميم التطعيم، هي المجالات الرئيسية التي تلعب فيها المعلوماتية الحيوية دورا حاسما جدا.<br>للتحقيق في المواقع الوظيفية على البروتين والتنبؤ من مواقع ملزمة بقايا في البروتينات، والاتصال المسافة على عتبة مختلفة من البروتين هياكل ثلاثية الأبعاد (ملف PDB) المطلوبة دائما [3، 4]. تمشيط معلومات موقع ملزم التي تم الحصول عليها من هياكل PDB مختلفة يتطلب العمل الشاقة إلى<br>محاذاة تسلسل البروتين. وتصبح العملية صعبة للغاية عندما يكون لدى الباحثين مجموعة كبيرة من البروتينات لتحليلها، وهو ما يحدث عادة في الممارسة العملية [4]. هناك العديد من قواعد البيانات التي مفيدة أيضا لتحديد مواقع الربط، و SC-PDB هو عبارة عن مجموعة من 6 415 هياكل ثلاثية الأبعاد من مواقع الربط الموجودة في بنك بيانات البروتين (PDB). تم استخراج مواقع الربط من جميع الهياكل الكريستالية عالية الدقة التي يمكن فيها أن يكون مجمع بين تجويف البروتين و ligand صغير الوزن الجزيئي identi-fied. الأهم من ذلك، تعتبر يغاندس من الدوائية وليس من وجهة نظر نقطة الهيكلية [5]. PDB-Ligand (http://www.idrtech.com/PDB-Ligand/) قاعدة بيانات بنية الأبعاد من اليغانندات الجزيئية الصغيرة التي ترتبط بالجزيئات الحيوية الأكبر المودعة في بنك بيانات البروتين (PDB). هذه الأداة التي تسمح للمرء بتصفح هذه الهياكل وتصنيفها وتركيبها وتصورها [6]. دقيقة صغيرة جزيء ملزمة موقع infor-mation للبروتين يمكن أن تسهل الدراسات في الالتحام المخدرات، واكتشاف المخدرات والتنبؤ وظيفة، ولكن جزيء صغير ربط موقع البروتين تسلسل الشرح متناثرة. تم إنشاء قاعدة بيانات التفاعل الجزيء الصغيرة (SMID)، وهي قاعدة بيانات لتفاعلات الجزيئات الصغيرة في مجال البروتين، باستخدام بيانات هيكلية من بنك بيانات البروتين (PDB) [7]. قاعدة بيانات أخرى مفيدة هي PPDMS ligand ثنائية
正在翻譯中..