model and plans to maintain this fo

model and plans to maintain this focus as they
pursue clinical applications. Jill Hagenkord, the
company’s chief medical officer, notes that such
thorough sequencing offers a powerful means
for identifying the types of structural rearrangements
that are abundant in cancer genomes
with a resolution unachievable with traditional
karyotypic methods. “It’s actually much more
informative and appealing than doing a targeted
resequencing for pathway analysis,” she says.
Several pilot academic efforts in this arena are
also looking to maximize their data collection in
the longer term. “Once we get turnaround times
and costs down, I would prefer a comprehensive
assessment to a focused one,” says Chinnaiyan.
Another important question is whether to
stop at the genome itself or to attempt to couple
that data with other ‘omic’ analyses. Given that
many cancer diagnostic tools now on the market
track shifts in gene expression, it is unsurprising
that many observers see transcriptomic analysis
as a valuable addition. Genomic Health of
Redwood City, California, has built a robust
business around its Oncotype DX family of
products, which use reverse transcriptase PCR
(RT-PCR) to profile shifts in the expression of
key genes linked with progression and risk of
recurrence for breast and colon cancer. The
company is now actively pursuing NGS-based
diagnostic solutions as well, but sees these as
complementing rather than replacing RT-PCR.
“We’re heavily invested in looking at both transcription
profiles and variations in somatic
sequence,” says CSO Joffre Baker.
MI-ONCOSEQ has made transcriptomics
a core component of their NGS workflow,
as has Alacris Theranostics, a Berlin-based
startup founded by Hans Lehrach, director of
the Department of Vertebrate Genomics at the
Max Planck Institute for Molecular Genetics.
“In tumor biology, the transcriptome is essential
information,” he says. “Tumors simply
select for eliminating brakes on growth and
don’t care whether that happens by deleting a
chromosomal region, acquiring a point mutation
in a gene exon or abnormal methylation of

結果 (中文) 1:

模型和计划，以维持这一重点，因为他们
追求的临床应用。
公司的首席医疗官，吉尔hagenkord指出，这样的
彻底的测序提供了一个强有力的手段识别的类型，结构重排的

，
，分辨率与传统的
核型的方法无法实现丰富的癌症基因组。 “它实际上是更
不是做有针对性的途径分析
重测序信息和有吸引力的，“她说。
几个试点在这一领域的学术努力的

从长远来看，也希望最大限度地提高其数据收集。说：“一旦我们得到的周转时间
和降低成本，我宁愿集中全面
评估，”Chinnaiyan博士。
另一个重要的问题是，是否
停在基因组本身或试图夫妇
，与其他“组学”分析的数据。
许多癌症的诊断工具，现在市场上的
跟踪的基因表达的变化，这是不足为奇
，许多观察家认为转录组分析
作为一个有价值的补充。 Genomic Health公司已经建立了一个强大的

加利福尼亚州雷德伍德城，业务遍布其oncotype DX系列的
产品，用逆转录聚合酶链反应（RT-PCR）
与发展和
乳腺癌和结肠癌的复发风险的关键基因，表达个人资料转移。
公司目前正积极寻求基于NGS-
诊断解决方案为好，但他认为这些
补充，而不是替代RT-PCR
“我们大量投资于在两个转录
配置文件和在体序列的变化，若夫尔贝克说：“CSO。，
MI-oncoseq有alacris治疗诊断学，总部位于柏林的
启动成立汉斯lehrach，主任转录
的核心组成部分，他们的NGS工作流程，

部门脊椎动物基因组学的
马克斯普朗克研究所分子遗传学。
“在肿瘤生物学，转录
信息是必不可少的，”他说。“肿瘤根本
选择对经济增长和消除刹车
不关心是否发生这种情况，删除
染色体区域，获得一个点突变的基因外显子或异常甲基化

結果 (中文) 2:

模型和计划保持这一重点，因为他们
追求的临床应用。吉儿hagenkord，该
公司的首席医疗官，指出，这种
深入测序提供了强有力的手段
确定类型的结构重排
是丰富的癌症基因组
决议无法与传统
核型的方法。“这实际上是更
信息和吸引力比做有针对性的
测序途径分析，”她说。
几个试点学术努力在这一领域
也寻求最大限度地提高他们的数据收集在
长期。“一旦我们得到的周转时间
和降低成本，我宁愿一个综合
评估重点，说：”chinnaiyan。
另一个重要问题是，是否
在基因组本身或试图对
数据与其他的经济分析。鉴于
许多癌症诊断工具，现在市场上的
轨道变化的基因表达，这是不足为奇的
，许多观察家认为，作为一个有价值的除了
转录分析。基因组健康
红木城，加利福尼亚，建立了一个强大的
业务围绕其安可待车系列
产品，采用逆转录聚合酶链反应（RT - PCR）
剖面变化的表达，
关键基因联系在一起的进展和风险
复发乳腺癌和结肠癌。该
公司目前正在积极追求ngs-based
诊断解决方案，以及，但认为这些作为
补充而不是取代
RT - PCR。”我们大量投资在寻找转录
分布和变化的躯体
序列，说：”所以霞飞贝克。
mi-oncoseq使转录
核心组成部分的许多工作流程，
已alacris治疗诊断学，位于柏林的一个
启动所创立lehrach，主任
部脊椎动物基因组学在
普朗克大学分子遗传学
。”肿瘤生物学，转录是必不可少的
信息，”他说。“肿瘤只是
选择消除刹车的生长和
不管发生
删去一个染色体区域，获得一个点突变
基因外显子或异常甲基化

結果 (中文) 3:

模型和计划，以维持这一重点作为他们
追求临床应用。Jill Hagenkord，
公司的首席医疗官、 指出，这种
彻底测序提供了有力手段
用于标识的类型的结构重排
，具有丰富的癌症基因组
与一项决议，无法实现与传统
染色体的方法。"这是实际上更多
内容翔实和吸引力比做针对性
重测序服务的途径分析，"她说。
在这个舞台上的几个试点学术努力
也在寻求最大限度地在他们的数据集合
长远。"我们一旦周转时间
和成本下，我宁愿全面
评估到重点突出一个"说 Chinnaiyan。
另一个重要的问题是是否到
停止在本身的基因组，或试图对夫妇
与其他 '夏初' 分析数据。鉴于
现在市场上的许多癌症诊断工具
轨道转移基因表达，也就不足为奇了
许多观察家看到宿主分析
作为一种重要补充。基因组健康的
加州红木城，建立了一个强健的
商业周围及其 Oncotype DX 系列
产品，其中使用逆转录酶 PCR
(RT-PCR) 到配置文件中表达的转移
关键基因与进展和风险挂钩
复发的乳腺癌和结肠癌。
公司是现在积极推行基于本国一般事务的
诊断解决方案也一样，但认为这些是
补充而不是替代 RT-PCR.
"我们正在大量投资，看这两个转录
概况和体细胞变异
序列，"说，CSO 若夫尔贝克。
MI ONCOSEQ 取得了 transcriptomics
他们本国一般事务的工作流程，核心组件
有 Alacris Theranostics，基于柏林的
Hans Lehrach，主任由创立的启动
脊椎动物基因组学在部
马克斯 · 普朗克研究所分子遗传学。
"在肿瘤生物学，转录过程是必不可少的
信息，"他说。"肿瘤只需
选择消除增长的制动器和
不要照顾是否发生删去
染色体区域，获取基因点突变
基因外显子或异常甲基化的中